Mk1C is a compact, portable device, combining the hardware for running nanopore
sequencing experiments with fully integrated compute used for basecalling and onward analysis. The device is entirely self-contained
and requires no other computing resource.
MinION Mk1C整合了测序芯片与MinIT计算模块,并配置了高分辨显示屏,不需连接电脑,可在任何环境下,对任意物种,便捷地进行实时、快速的测序。MinION Mk1C可以使用MinION和Flongle两种芯片。特别适用于野外条件下的快速鉴定。其中,使用MinION芯片,每块芯片最高可产出30Gb数据。使用更小的Flongle芯片,进行小量快速测序。适用于从微生物、宏基因组、RNA和cDNA,到全基因组测序的任何测序类型。
The MinION Mk1C can be used with MinION flow cells and the Flongle adapter and flow cells. Users can operate the system in an offline
or online mode, enabling full sequencing and analysis to be performed in the lab and field. A high-definition touch screen means users
receive constant feedback regarding experiment progression and can easily interact with the device, without additional hardware. 1.超长读长
在纳米孔测序中,读长长度不受限于测序设备,用户可以通过所使用的文库制备实验方案来控制片段长度。目前报到处DNA片段长度最高记录为>2 Mb,直接RNA测序读长最长26kb。
2.直接测序
纳米孔技术基于电子学原理,允许直接测序原始DNA和RNA。不需要通过DNA拷贝、进行链合成或使用亚硝酸盐进行转化,这不仅节省了时间和成本,还意味着碱基修饰的信息(例如5mC,pseudouridine,m6A)会被完整的保留,并且包含在测序运行产生的原始信号信息中,随时进行分析。由于纳米孔技术支持无需PCR的直接测序,也就没有了扩增偏好性,并且文库制备工作流程也更简单。
3. 实时测序
纳米孔技术提供的是动态、实时的测序,支持在几分钟内就获得病原体鉴定等时间关键型应用的检测结果。测序时,DNA快速通过纳米孔。DNA片段通过纳米孔的速率已从推出时的每秒35个碱基提升到了现在每秒450个碱基。每一个在阵列上完成的读长,在数秒后就可以用来开始数据分析,用户可以在测序早期了解样本的质量和状态,也可以在获得足够的数据后停止测序。 4.按需要测序
在纳米孔测序中,用户可以自行掌握测序时间、地点、以及需要使用的芯片数量。例如,可以单次使用的最小型的测序芯片Flongle适合快速质量检测、小型基因组实验和靶向测序。
5.启动费用低
传统的高通量测序价格昂贵,启动需要数十万至百万人民币。而纳米孔测序目前启动套装只需要17271元,包括MinION测序仪,两张测序芯片,一盒建库试剂盒,一盒清洗试剂盒。两张芯片最多可以测序60G数据。
6.灵活、可扩展
所有Oxford Nanopore测序设备使用同样的核心技术,用户可以轻松根据应用测试实验以及扩大或缩小规模。从最小型的Flongle和掌上MinION,到桌面型的GridION和PromethION。所有设备都可用于进行按需测序实验。
无
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